MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-10

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012133	T	7	7	2	8	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012133	TTA	2	6	29	34	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012133	TA	4	8	33	40	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012133	ATT	2	6	44	49	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012133	TAA	2	6	50	55	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012133	AAG	2	6	56	61	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012133	AGA	2	6	3364	3369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012133	AGG	2	6	3376	3381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012133	AAAT	2	8	3978	3985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012133	ATT	2	6	10300	10305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012133	T	8	8	15063	15070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012133	TA	3	6	15092	15097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012133	AT	4	8	15098	15105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012133	A	6	6	15114	15119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012133	AAG	2	6	15661	15666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012133	A	7	7	16364	16370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012133	AAT	3	9	16413	16421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012133	CTC	2	6	17381	17386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_012133	TTC	2	6	17391	17396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012133	TA	3	6	17409	17414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012133	A	6	6	17416	17421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012133	T	8	8	17435	17442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012133	A	6	6	17445	17450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012133	T	6	6	17451	17456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012133	A	6	6	17459	17464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012133	TAA	2	6	17564	17569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012133	CTAC	2	8	17571	17578	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012133	A	7	7	17628	17634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012133	TTG	2	6	17669	17674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012133	TAA	2	6	17679	17684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012133	TA	3	6	18881	18886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012133	TAAA	2	8	20207	20214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012133	AAT	2	6	21472	21477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012133	T	6	6	21489	21494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012133	GTG	2	6	21503	21508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012133	T	7	7	21514	21520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012133	ATT	2	6	21537	21542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012133	TA	3	6	21553	21558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012133	A	7	7	21569	21575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012133	TTA	2	6	21624	21629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012133	T	9	9	21650	21658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012133	A	6	6	21661	21666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012133	T	6	6	21667	21672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012133	A	6	6	21675	21680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012133	T	6	6	21695	21700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012133	TA	3	6	21702	21707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012133	GAA	2	6	21720	21725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012133	A	7	7	23084	23090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012133	GGA	2	6	23103	23108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012133	AAGTAA	2	12	24358	24369	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012133	AGT	2	6	24467	24472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012133	CA	3	6	24507	24512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012133	TG	3	6	24530	24535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012133	AT	3	6	24536	24541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012133	AATTT	2	10	24556	24565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012133	GA	3	6	24611	24616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012133	TTA	2	6	24628	24633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012133	ATT	2	6	24684	24689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012133	A	7	7	24699	24705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012133	ATT	2	6	24711	24716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012133	GGAGTA	2	12	24745	24756	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012133	GTT	2	6	25589	25594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012133	ATTA	2	8	25621	25628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012133	AAAAG	2	10	25629	25638	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012133	TAG	2	6	25720	25725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012133	TAAG	2	8	25736	25743	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012133	TAA	2	6	25758	25763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012133	TAT	2	6	25779	25784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.